5 dk okuma
Batı Geyik Farelerinde Sin Nombre Virüsü: Kuzeybatı ABD'de Yeni Bulgular

Batı Geyik Farelerinde Sin Nombre Virüsü: Kuzeybatı ABD'de Yeni Bulgular

İçindekiler

Batı geyik fareleri, genellikle fark edilmeyen küçük, iri gözlü ve yumuşak tüylü canlılardır. Amerika'nın batısında ahırlarda ve alet depolarında kendiliğinden ortaya çıkarlar ve çoğu insan onları fark etse bile ikinci bir düşünceye kapılmaz. Ancak bu durum, tam da sorunun kaynağını oluşturuyor. Doğu Washington ve Batı Idaho'daki Palouse bölgesindeki kemirgenler üzerinde yapılan yeni bir çalışma, yakalanan batı geyik farelerinin yaklaşık %26'sında, hastaneye yatırılanların yaklaşık üçte birinin ölümüne neden olan solunum sendromundan sorumlu hantavirüs olan Sin Nombre virüsünün geçmiş enfeksiyonuna dair serolojik kanıtlar bulunduğunu ortaya koydu. Farelerin yaklaşık %10'unun ise yakalandıkları sırada aktif olarak enfekte olduğu belirlendi. Araştırmacıların kendi ifadelerine göre bu oranlar şaşırtıcıydı.

Belki de daha da dikkat çekici olan, bu durumun neden bir sürpriz olduğuydu. 1993'ten bu yana Idaho, Oregon ve Washington'da kaydedilen 109 hantavirüs pulmoner sendrom vakasına rağmen, bu çalışma öncesinde kuzeybatı Amerika Birleşik Devletleri'nden virüsün tam genom dizilemesi neredeyse hiç yapılmamıştı. Basitçe ifade etmek gerekirse, gözümüzün önünde saklanan, büyük ölçüde haritalanmamış bir popülasyon ölçekli tehdit söz konusuydu.

Her Zaman Burada Olan Bir Virüs

İspanyolca'dan "adı olmayan virüs" anlamına gelen Sin Nombre virüsü (SNV), ilk olarak 1993 yılında güneybatıdaki Dört Köşe (Four Corners) bölgesi yakınlarındaki bir salgın sırasında kamuoyunun dikkatini çekti. Vakalar şiddetli ve aniydi: sağlıklı yetişkinlerde günler içinde solunum yetmezliği gelişiyordu. Suçlu olarak, büyük ölçüde Peromyscus cinsine ait geyik farelerinde bulunan ve idrar, dışkı ve yuvalama malzemeleriyle atılan bir hantavirüs belirlendi. İnsanlar, kontamine bir alanı rahatsız ettiklerinde virüsü kapıyordu. Tozlu bir ahırı süpürmek, uzun süre kapalı kalmış bir kabini açmak veya bir mülkün kemirgenlerin barındığı köşesinde yaprak üfleyici çalıştırmak gibi eylemler risk oluşturuyordu. 1993'ten 2022'ye kadar ABD'de yaklaşık %36 ölüm oranına sahip 864 vaka kaydedildi. Bu yaygın olmasa da göz ardı edilemeyecek bir rakamdı.

Yeni çalışma, bu tabloyu önemli ölçüde karmaşıklaştırıyor. Washington State Üniversitesi Küresel Sağlık Okulu'ndan Stephanie Seifert liderliğindeki araştırma ekibi, 2023 yazında çiftlikler ve doğal alanlarda 189 kemirgen tuzağı kurdu. Serumları antikorlar için ve akciğer dokularını aktif viral RNA için test ettiler. Dağ sıçanlarında (montane voles) ise durum çarpıcıydı: %50'si seropozitif ve akciğer dokularında PCR ile %22'si pozitif çıktı. Sıçanlar, bu virüsün bilinen ana taşıyıcısı değildir. Bu türlerde bu oranlarda virüsün bulunması, tek bir konakçı ile sınırlı bir bulaşma hikayesinden daha dinamik bir durumun varlığına işaret ediyor.

Seifert, “Hem virüsün yerel olarak ne kadar yaygın olduğuna hem de Kuzeybatı için ne kadar az veri bulunduğuna şaşırdık. Bu virüsün buradaki kemirgen popülasyonlarında ne kadar yaygın ve karmaşık olduğunu ancak anlamaya başlıyoruz” dedi.

Buğday Tarlalarında Viral Yeniden Düzenlenme

Palouse bulgularını önemli kılan şey sadece virüsün yaygınlığı değil, aynı zamanda genomik yapısıdır. Ekip, iki dağ sıçanı dahil olmak üzere on farklı hayvandan tam Sin Nombre virüsü genomları diziledi ve bu bölgeden elde edilen ilk tam genom dizilerini üretti. Bu dizilerde buldukları, virüsün dikkat etmemiz gereken bir şey yaptığını gösteriyor: yeniden düzenlenme (reassortment). Hantavirüsler, grip virüsleri gibi parçalı genomlara sahiptir. Bu, iki farklı virüs türü aynı hücreyi enfekte ettiğinde genetik segmentlerini değiştirebilecekleri ve yeni hibrit varyantlar üretebilecekleri anlamına gelir. Filogenetik analiz, üç genom segmenti boyunca topolojik tutarsızlıklar gösterdi; bu da tam olarak bu karışımanın sahada gerçekleştiğini gösteren bir imzadır. Palouse dizileri, 2008-2009 civarında Montana'dan toplanan SNV genomlarıyla en yakın kümeyi oluşturdu. Filocoğrafik yeniden yapılandırma, virüsün yaklaşık 1915 civarında, birkaç on yıllık belirsizlik payıyla Washington'a Montana'dan girmiş olabileceğini düşündürüyor.

Bu yeniden düzenlenmenin insan riski açısından bir şeyi değiştirip değiştirmediği şu an için belirsiz. Ancak bu durum, virüsün aktif olarak çeşitlendiği, birden fazla kemirgen türünün virüsü olası bir şekilde paylaştığı ve ABD genelinden toplanan 100'den az tam Sin Nombre dizisini içeren mevcut genomik referans kütüphanesinin, neler olup bittiğini takip etmek için kesinlikle yetersiz olduğu anlamına geliyor. Ekip ayrıca teknik bir zorlukla karşılaştı: orta genom segmentinde, mevcut dizileme primerlerinin kurtaramadığı kalıcı bir düşüş yaşandı ve bu durum, boşluğu doldurmak için yeni çeper primerlerinin tasarlanmasını gerektirdi. Bu, kağıt üzerindeki küçük bir metodolojik not olsa da, bu bölgede bir gözetim programı oluşturmaya çalışan herkes için önemliydi.

Ayrıca, erkek kemirgenlerin dişillere göre akciğer dokusunda PCR ile pozitif çıkma olasılığının yaklaşık dokuz kat daha fazla olduğu bulundu. Bunun nedeni tam olarak anlaşılamamış olsa da (muhtemelen erkeklerin daha geniş hareket alanına sahip olması ve enfekte hemcinsleriyle daha fazla karşılaşmasıyla ilgilidir), SNV ekolojisinde tutarlı bir örüntüdür ve maruz kalma riskini modelleyenler için akılda tutulmaya değer olabilir.

Maruziyet ve Teşhis Arasındaki Boşluk

Tüm bu bulguları birleştiren bir nokta, insan tarafında neleri kaçırdığımız sorusudur. Kemirgenlerde virüsün yaygınlığı yüksek. İnsan vakaları mutlak terimlerle nadir kalmaya devam ediyor. Bu iki gerçek çelişmiyor olabilir, ancak bir soru ortaya atıyor: İnsanlar gerçekten virüse maruz kalmıyor mu, yoksa yalnızca şiddetli vakalar hantavirüs testi yapılmasını gerektirdiği için hafif veya asemptomatik maruziyetler kaydedilmeden mi geçiyor?

WSU'da bir hastalık ekoloğu ve çalışmanın ortak yazarlarından Pilar Fernandez, ikinci olasılığın açıklamanın bir parçası olduğunu düşünüyor. Fernandez, “İnsanlar fark ettiğimizden daha sık maruz kalıyor olabilir, ancak şiddetli vakaların hantavirüs testi yapılması daha olasıdır” dedi. Maruziyetin hastalığa nasıl dönüştüğünü anlamak, bir sonraki büyük adım olduğunu belirtti.

Bu durum, bir bakıma, ortaya çıkan bulaşıcı hastalık gözetiminde tanıdık bir problemdir. Yakaladığınız vakalar en şiddetli olanlardır. Hafif enfeksiyonların, subklinik maruziyetin veya hastaneye yatış olmadan bağışıklık sisteminin virüsü temizlemesinin arka plan oranı, genellikle özel araçlarla araştırılmadıkça görünmez kalır. Bu tür araştırmalar genellikle insanlarda değil kemirgenlerde yapılan bir seroprevans çalışmasıyla yapılır. Bu tür çalışmalar henüz burada yapılmadı. Bunun nedenleri arasında, bu tür bölgesel gözetim için fonların sürekli yetersiz olması ve hantavirüsün, daha fazla manşetlere çıkan patojenlere kıyasla aynı kalıcı ilgiyi çekmemesi yer alıyor. WSU ekibi, ek fon sağlanması durumunda çalışmalarını genişletmeyi umduklarını belirtiyor.

Bu arada, çiftliklerin, binaların veya kemirgenlerin yuva yapabileceği herhangi bir yerin yakınında zaman geçiren insanlar için pratik tavsiyeler otuz yıldır olduğu gibi aynı kalıyor: içeri girmeden önce kapalı alanları havalandırın, kuru süpürmekten kaçının, tozu karıştırmak yerine ıslak paspas yapın ve kemirgen kokusu gelen herhangi bir alana uygun şekilde dikkatle yaklaşın. Yeni verilerin eklediği şey ise daha az eyleme dönük ama belki de daha önemli bir hatırlatmadır: Kırsal Kuzeybatı'nın tarlalarında ve çiftliklerinde gelişip çeşitlenen tehlikeli bir patojenin, genomik kayıtların büyük ölçüde dışında kaldığı. Şimdiye kadar etkili bir şekilde kör uçmuştuk.

Sıkça Sorulan Sorular

Bu kadar çok kemirgen hantavirüsü taşıyorken neden daha fazla insan hastalanmıyor?
Maruziyet, kontamine kemirgen dışkısı, idrarı veya yuvalama malzemelerinden aerosolize olmuş partiküllerin solunmasıyla gerçekleşir. Bu genellikle yalnızca insanların nadiren ziyaret edilen kapalı alanları rahatsız etmesiyle olur. Ayrıca araştırmacılar, hafif veya asemptomatik enfeksiyonların, hantavirüs testlerinin genellikle şiddetli vakalarla sınırlandırıldığı için tespit edilmeden geçebileceğini düşünüyor. Pasifik Kuzeybatı'daki gerçek insan maruziyet oranı açık bir sorudur ve WSU ekibinin bir sonraki araştırmak istediği konudur.
Virüsün kemirgen türleri arasında "yeniden düzenlenmesi" ne anlama geliyor?
Sin Nombre virüsü, grip virüsü gibi parçalı bir genoma sahiptir, bu da iki farklı türün aynı anda bir hayvanı enfekte ettiğinde genetik segmentleri değiştirebilecekleri ve yeni hibrit varyantlar üretebilecekleri anlamına gelir. Palouse çalışması, aynı tarım arazilerinde geyik fareleri ve dağ sıçanları arasında bu tür bir karışımın gerçekleştiğine dair genetik imzalar buldu. Bu durum, virüsün daha tehlikeli hale geldiği anlamına gelmeyebilir, ancak patojenin aktif olarak evrimleştiği ve tek bir rezervuar türünü izlemeye dayalı bir gözetim sisteminin resmin bir bölümünü kaçırıyor olabileceği anlamına gelir.
Daha önce neden Pasifik Kuzeybatı'da bu virüs dizilenmedi?
Bu, araştırmacıların bölgenin vaka geçmişi göz önüne alındığında şaşırtıcı olarak tanımladığı bir veri boşluğudur. ABD genelinde 100'den az tam Sin Nombre genom dizisi bulunmaktadır ve bu çalışmadan önce hiçbiri Kuzeybatı'dan gelmemiştir. Hantavirüs gözetimi tarihsel olarak, virüsün ilk tanımlandığı Dört Köşe bölgesine odaklanmıştır. Bölgesel gözetim çalışmaları, yıllık vaka sayısı nispeten az olsa bile, bu vakalar şiddetli olsa bile, sürdürülebilir finansman gerektirir. Ancak bu tür patojenler için bu tür destekler her zaman sağlanamamaktadır.
Dağ sıçanları bu virüs için yeni bir rezervuar mıdır?
Çalışma, çiftliklerde yakalanan dağ sıçanlarının %50'sinde Sin Nombre virüsü antikorları ve yaklaşık %22'sinde aktif enfeksiyon buldu. Bu, geleneksel olarak birincil rezervuar olarak kabul edilmeyen bir türde dikkat çekici derecede yüksek bir prevalanstır. Araştırmacılar daha önce geyik fareleri dışındaki diğer kemirgen türlerinde de SNV bulmuşlardı ve Palouse bulguları, türler arası bulaşmanın standart geyik-fare merkezli modelin ima ettiğinden daha yaygın olabileceğini düşündürüyor. Sıçanların virüsü sürdürmede sürekli bir rol oynayıp oynamadığı veya esas olarak aynı habitatı paylaşan geyik farelerinden virüsü kapıp kapmadığı henüz belirlenmemiştir.
Ayşe
Ayşe Demir

Teknolojinin geleceğini şekillendiren yenilikleri ve trendleri yakından takip eden deneyimli bir analist.

Kullanıcı Yorumları